牙结石和牙垢中存在大量的厌氧菌及“养分”，并且还为它们提供了一层保护膜，使得这些污垢不容易被唾液冲走。
厌氧菌在这里分解食物残渣，制造口臭，同时还会进一步破坏牙龈，诱发牙周疾病。除此之外，厚腻的舌苔也容易寄生大量的厌氧菌，同样是产生口臭的主要原因之一。
牙周病引发严重口臭。口腔中的龋齿、残根、残冠，都容易成为食物残渣的窝藏点。食物残渣在这里经过厌氧菌的分解发酵，就会产生难闻的臭气。相对来说，牙周炎、牙龈炎的患者口臭更严重。
因为牙龈发炎常常会导致出血、流脓，这些脓液混杂着唾液，在细菌的作用下便会产生腐败的腥臭味。
