蜂胶不仅具有广谱抗菌作用，有效防止细菌繁殖导致变质。但是，由于蜂胶成分复杂，一些易挥发的物质(如萜烯类)对光、热敏感，因此建议将蜂胶产品存放在避光、阴凉处。
蜂胶被认为是安全的食品，正常体质的人每日摄入纯蜂胶2克以上，最高可达3-5克，均无毒副作用。即使是过敏体质者，每日摄入量不超过0.75克也不会产生任何副作用。然而，任何食物、药品都存在一定的量效关系，过度摄入是不必要的，但摄入不足也无法达到应有的效果。根据目前的临床实践，每人每天摄入1-2克提纯蜂胶为宜。如果按照每克提纯蜂胶中黄酮的平均含量为15%计算，则每人每天应摄入黄酮类化合物150-300毫克。在治疗疾病时，应适当增加用药量。
以含量为25%的蜂胶液为例，初次服用建议1-3滴，如无过敏反应，可逐渐增加剂量。用于保健时，每次建议服用10-15滴，每天2次;治疗普通疾病时，每次建议服用15-20滴，每天3次;治疗癌症时，可增至每次30-40滴，每天2次。儿童的服用量应减半或更少。
一般建议空腹服用蜂胶，以便更有效地吸收其营养成分，但对胃部有一定刺激性。胃部不佳的人不宜空腹服用，糖尿病患者可选择饭后半小时服用。
