冬虫夏草的采集尤为重要。
一般是在夏至前后，当积雪尚未溶化时入山采集，此时子座多露于雪面，容易发现和采挖，虫草的生长旺季只有15到20天左右，在旺季采挖的虫草，不但虫体充实饱满，菌苗茂盛而肥壮，且产量、质量、药效都较高。
如果过早采挖，多数还未出土，不宜寻找和采挖；过迟则积雪溶化，杂草生长，不易找寻，过晚则菌苗萎缩或干枯，虫体空心或腐烂，不合药用。
挖起后，在虫体潮湿未干时，除去外层的泥土及膜皮，晒干。或再用黄酒喷之使软，整理平直，每7～8 条用红线扎成小把，用微火烘干。
冬虫夏草以个体饱满、色泽光亮、断面黄白色，菌座短小粗壮者为佳，并非虫体越大越好。
